Los analisis filogenéticos con máxima verosimilitud e inferencia bayesiana
Los análisis filogenéticos con máxima verosimilitud e inferencia bayesiana son dos enfoques computacionales utilizados en biología evolutiva para reconstruir la historia evolutiva de un grupo de organismos. Ambos métodos buscan estimar la relación filogenética entre las especies a partir de datos moleculares, morfológicos u otros tipos de datos.
La máxima verosimilitud es un enfoque que busca encontrar el árbol filogenético que maximiza la probabilidad de observar los datos bajo un modelo evolutivo específico. Este método evalúa diferentes topologías de árboles y parámetros del modelo para determinar cuál es la más probable dada la información disponible.
Por otro lado, la inferencia bayesiana es un enfoque que utiliza el teorema de Bayes para estimar la probabilidad de un árbol filogenético dado los datos observados y una distribución previa de probabilidad. En este método, se generan múltiples árboles filogenéticos a partir de cadenas de Markov Monte Carlo, y se calcula la probabilidad de cada árbol en función de la distribución previa y los datos observados.
Ambos enfoques tienen sus ventajas y desventajas, y su elección dependerá de la naturaleza de los datos y de las preguntas específicas que se quieran responder en el análisis filogenético. En general, la máxima verosimilitud tiende a ser más rápida computacionalmente, mientras que la inferencia bayesiana permite incorporar de manera más flexible la incertidumbre en los parámetros del modelo y en la topología del árbol filogenético.