Método de máxima similitud codigo fuente

El método de máxima similitud es un enfoque utilizado en bioinformática para estimar la evolución de secuencias genéticas. A continuación te muestro un ejemplo de código en Python que implementa el método de máxima similitud para estimar un árbol filogenético a partir de secuencias de ADN:

```python

from Bio import Phylo

from Bio.Phylo.TreeConstruction import DistanceCalculator, DistanceTreeConstructor

from Bio import AlignIO

# Cargar las secuencias de ADN desde un archivo en formato FASTA

alignment = AlignIO.read("secuencias.fasta", "fasta")

# Calcular las distancias entre las secuencias usando el método de máxima similitud

calculator = DistanceCalculator('identity')

dm = calculator.get_distance(alignment)

# Construir el árbol filogenético usando el método de máxima similitud

constructor = DistanceTreeConstructor(calculator)

tree = constructor.build_tree(alignment)

# Dibujar el árbol filogenético resultante

Phylo.draw(tree)

```

En este código, se utilizan las bibliotecas Biopython para cargar las secuencias de ADN, calcular las distancias entre ellas y construir el árbol filogenético. Asegúrate de tener instaladas las bibliotecas necesarias antes de ejecutar este código. También necesitarás un archivo "secuencias.fasta" con las secuencias de ADN en formato FASTA.

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